PhD Student (d/w/m) Translationale Forschung im Bereich Solide Tumore

PhDBerlin
Posted
First seen 30 October 2026 (today)
Deadline
Not specified
Department
Not specified
Category
PhD
Employment type
Not specified
Language
Not specified

Summary

• Translationale Promotionsarbeit mit bioinformatischem Schwerpunkt zur Identifikation räumlicher und molekularer Biomarker für die Stratifizierung von Metastasierungsrisiko und Überleben sowie für gezielte Therapieansätze • Analyse und Integration multimodaler Einzelzell- und räumlicher Datensätze, einschließlich Single-Nucleus-Sequenzierung, Xenium-Spatial-Transcriptomics und Protein-Imaging, zur Charakterisierung von Tumor-Immun-Nichen • Analyse räumlicher Ligand–Rezeptor-Interaktionen, Proximität und Nischen, um zu bestimmen, wie Tumorgenotypen und Tumorzustände mit spezifischen Immunzellsubtypen kolokalisieren und interagieren • Analysen der differenziellen Zellzusammensetzung, von Signalwegen und räumlich variablen Genen über klinisch relevante Vergleiche • Ableitung nachfolgender mechanistischer Validierung und Translation der Ergebnisse in valide Biomarker für Risikostratifizierung und gezielte Therapie, in enger Zusammenarbeit mit Klinikerinnen / Kliniker und Wet-Lab-Wissenschaftlerinnen / Wissenschaftler (einschließlich Kooperationen am MDC / BIMSB und an DKTK-Standorten) • Anwendung eines breiten Methodenspektrums: Einzelzell- und räumliche Transkriptomik, RNA-Sequenzierung, Multiplex-Imaging, hochdimensionale Datenintegration sowie reproduzierbare und skalierbare bioinformatische Workflows • Sie werden als wissenschaftliche Mitarbeiterin / wissenschaftlicher Mitarbeiter beschäftigt: Nach §110 (4), Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor

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