Wiss. Mitarbeiter/in (d/m/w) - 65 % Arbeitszeit

Kurzbeschreibung

Kultivierung humaner Zellen und In-cell-Crosslinking unter basalen und veränderten Bedingungen (z. B. Wirkstoffbehandlung, Stress) Optimierung und Benchmarking chemischer und photoaktivierbarer Crosslinking-Reagenzien hinsichtlich Effizienz, Membrangängigkeit und biologischer Aussagekraft Kopplung des Crosslinkings mit subzellulärer Fraktionierung (Zytosol, Zellkern, Membranen) zur Anreicherung kompartimentspezifischer Proteinkomplexe Probenvorbereitung für proteomweite Crosslinking-MS (Verdau, Anreicherung, mehrdimensionale Fraktionierung) sowie LC-MS/MS-Messungen (Orbitrap, Astral) Datenauswertung mit xiSEARCH/xiFDR und Mitarbeit an der Verbesserung von Spektrenzuordnung und Fehlerabschätzung (FDR), u. a. durch systematische Untersuchung von - Artefakten wie nicht-kovalent assoziierten Peptidpaaren Validierung der Crosslink-Daten an bekannten Komplexen und Abgleich mit CF-MS- und AP-MS-Daten der Projektpartner; Aufbereitung als Distanz-Restraints für die Strukturmodellierung Enge Zusammenarbeit im internationalen Konsortium, offene Bereitstellung von Daten und Protokollen (EMBL-EBI/PRIDE), Präsentation und Publikation der Ergebnisse Die Möglichkeit zur Promotion ist gegeben

• Studentische Beschäftigung mit 40 Monatsstunden

  Sonstiges · Fakultät VI - Planen Bauen Umwelt, Institut für Stadt- und Regionalplanung - FG Raumordnung und Regionalentwicklung

• Studentische Beschäftigung mit 40 Monatsstunden

  Sonstiges · Fakultät VI - Planen Bauen Umwelt, Institut für Ökologie - FG Stadtökologie

• Studentische Beschäftigung mit 40 Monatsstunden

  Sonstiges · Fakultät VI - Planen Bauen Umwelt, Institut für Bauingenieurwesen - FG Bauphysik

• Studentische Beschäftigung mit 40 Monatsstunden

  Sonstiges · Fakultät VII - Wirtschaft und Management, Institut für Volkswirtschaftslehre und Wirtschaftsrecht - FG Wirtschafts- und Infrastrukturpolitik

• Studentische Beschäftigung mit 40 Monatsstunden

  Sonstiges · Fakultät IV - Elektrotechnik und Informatik, Institut für Softwaretechnik und Theoretische Informatik - FG Machine Learning and Security

• Studentische Beschäftigung mit 40 Monatsstunden

  Sonstiges · Fakultät III - Prozesswissenschaften, Institut für Lebensmitteltechnologie und Lebensmittelchemie - FG Lebensmittelverfahrenstechnik